Zgłoszenie restrukturyzacji do urzędu skarbowego – obowiązki i terminy

Zgłoszenie restrukturyzacji do urzędu skarbowego

autor: TKW Kancelaria 

data publikacji: 11.07.2025 r. 

Zgłoszenie restrukturyzacji do organów podatkowych – obowiązki i terminy

Procesy restrukturyzacyjne, niezależnie od ich skali i formy, wiążą się z licznymi obowiązkami informacyjnymi wobec organów podatkowych i innych instytucji publicznych. Niedopełnienie tych obowiązków może prowadzić do poważnych konsekwencji prawnych i finansowych, włącznie z odpowiedzialnością prawną i finansową osób zarządzających. Dlatego tak istotne jest prawidłowe i terminowe zgłaszanie wszelkich zmian wynikających z reorganizacji. W niniejszym artykule przedstawiamy kompleksowy przegląd obowiązków informacyjnych związanych z restrukturyzacją, wraz z praktycznymi wskazówkami dotyczącymi ich realizacji.


Kiedy istnieje obowiązek zgłoszenia restrukturyzacji?

Obowiązek informowania organów podatkowych o przeprowadzonej restrukturyzacji pojawia się w różnych przypadkach, zależnie od formy i zakresu reorganizacji.

Przekształcenie formy prawnej

Proces przekształcenia formy prawnej przedsiębiorstwa (np. jednoosobowej działalności gospodarczej w spółkę z o.o. czy spółki jawnej w spółkę komandytową) wymaga:

  • Zgłoszenia zmiany formy prawnej do właściwego urzędu skarbowego

  • Aktualizacji danych w rejestrze CEIDG lub KRS

  • Informacji o zmianie w Centralnym Rejestrze Beneficjentów Rzeczywistych (CRBR)

  • Aktualizacji zgłoszeń rejestracyjnych VAT (VAT-R)

Przekształcenie nie skutkuje powstaniem nowego podmiotu w sensie podatkowym (zachowany jest ten sam NIP), jednak wymaga aktualizacji danych we wszystkich rejestrach.

Połączenie i podział spółek

W przypadku fuzji lub podziału spółek obowiązki informacyjne obejmują:

Połączenie przez przejęcie:

  • Zgłoszenie przez spółkę przejmującą aktualizacji danych w KRS

  • Informacja do urzędu skarbowego o przejęciu praw i obowiązków spółki przejmowanej

  • Wyrejestrowanie spółki przejmowanej z rejestru podatników VAT

  • Aktualizacja danych w CRBR dotyczących beneficjentów rzeczywistych

Połączenie przez zawiązanie nowej spółki:

  • Rejestracja nowego podmiotu w KRS

  • Zgłoszenie nowego podmiotu jako podatnika VAT i CIT

  • Informacja o przejęciu praw i obowiązków łączonych spółek

  • Wyrejestrowanie łączonych spółek z rejestru podatników

Podział spółki:

  • Aktualizacja danych spółki dzielonej w KRS

  • Rejestracja nowych spółek powstałych w wyniku podziału

  • Zgłoszenie podziału odpowiedzialności za zobowiązania podatkowe

  • Aktualizacja lub nowa rejestracja dla celów VAT i CIT

Wniesienie aportu przedsiębiorstwa lub zorganizowanej części przedsiębiorstwa (ZCP)

Wniesienie aportem przedsiębiorstwa lub ZCP wiąże się z następującymi obowiązkami:

  • Zgłoszenie zmiany zakresu działalności przez podmiot wnoszący aport

  • Aktualizacja danych w rejestrach CEIDG lub KRS

  • Aktualizacja zgłoszeń rejestracyjnych VAT

  • W przypadku aportu całego przedsiębiorstwa – wyrejestrowanie z VAT podmiotu wnoszącego

Likwidacja lub zawieszenie działalności

Zakończenie lub zawieszenie działalności gospodarczej wymaga:

  • Zgłoszenia likwidacji/zawieszenia do organu podatkowego

  • Wyrejestrowania z rejestru podatników VAT

  • Złożenia deklaracji podatkowych za okres do dnia likwidacji/zawieszenia

  • W przypadku spółek – zgłoszenia otwarcia likwidacji do KRS

Zmiana siedziby lub miejsca prowadzenia działalności

Zmiana lokalizacji, często towarzysząca procesom restrukturyzacyjnym, wymaga:

  • Aktualizacji adresu w CEIDG lub KRS

  • Zgłoszenia zmiany właściwości miejscowej organu podatkowego

  • Aktualizacji adresu w zgłoszeniu rejestracyjnym VAT

  • Informacji o zmianie adresu prowadzenia ksiąg rachunkowych


Raportowanie MDR – schematy podatkowe

Obowiązek raportowania schematów podatkowych (Mandatory Disclosure Rules – MDR) stanowi stosunkowo nowe, ale niezwykle istotne wyzwanie w kontekście procesów restrukturyzacyjnych.

Kiedy restrukturyzacja podlega raportowaniu MDR?

Obowiązek raportowania powstaje, gdy restrukturyzacja spełnia definicję schematu podatkowego, czyli:

  • Spełnia kryterium głównej korzyści podatkowej – jedną z głównych korzyści jest uzyskanie korzyści podatkowej

  • Posiada ogólną cechę rozpoznawczą, np.:

    • Zobowiązanie do zachowania poufności

    • Wynagrodzenie promotora uzależnione od korzyści podatkowej

    • Standaryzowana dokumentacja lub struktura

  • Posiada szczególną cechę rozpoznawczą, np.:

    • Nabycie przedsiębiorstwa przynoszącego straty

    • Zmiana kwalifikacji dochodów

    • Transfer funkcji, ryzyk lub aktywów między podmiotami powiązanymi

  • Posiada inną szczególną cechę rozpoznawczą, np.:

    • Wpływ na odroczenie powstania obowiązku podatkowego

    • Możliwość uniknięcia obowiązku raportowania informacji o schematach podatkowych

Przykłady restrukturyzacji podlegających raportowaniu MDR

W praktyce raportowaniu MDR mogą podlegać m.in.:

  • Przekształcenie spółki kapitałowej w osobową w celu zmiany zasad opodatkowania

  • Reorganizacja prowadząca do skorzystania z preferencji podatkowej (np. IP Box)

  • Restrukturyzacja transgraniczna skutkująca obniżeniem efektywnej stawki podatkowej

  • Nabycie spółki ze stratami podatkowymi i wykorzystanie tych strat

  • Wniesienie aportem przedsiębiorstwa lub ZCP w celu odroczenia opodatkowania

Obowiązki i terminy raportowania

Obowiązki w zakresie raportowania MDR obejmują:

  • Dla promotora (np. doradcy podatkowego) – zgłoszenie schematu w terminie 30 dni od udostępnienia

  • Dla korzystającego (przedsiębiorcy) – zgłoszenie w terminie 30 dni od wdrożenia schematu, jeśli promotor nie dokonał zgłoszenia

  • Dla wspomagającego (np. banku) – zgłoszenie w terminie 30 dni od udzielenia wsparcia, jeśli podejrzewa, że uczestniczy w schemacie podatkowym

Zgłoszenie dokonywane jest na formularzu MDR-1, a informacja o zastosowaniu schematu na formularzu MDR-3.

Sankcje za niedopełnienie obowiązków MDR

Niezgłoszenie schematu podatkowego może skutkować:

  • Karą pieniężną do 10 mln zł dla promotora lub wspomagającego

  • Karą pieniężną do 21,5 mln zł dla podmiotu będącego spółką

  • Odpowiedzialnością karną skarbową (kara grzywny do 720 stawek dziennych)

  • Publikacją danych podatnika na stronie Ministerstwa Finansów


Aktualizacja danych w CEIDG, KRS, CRBR i urzędach skarbowych

Prawidłowa aktualizacja danych w rejestrach publicznych stanowi kluczowy element procesu restrukturyzacyjnego.

Centralny Rejestr i Informacja o Działalności Gospodarczej (CEIDG)

W przypadku jednoosobowych działalności gospodarczych konieczne jest:

  • Złożenie wniosku CEIDG-1 w terminie tygodnia od zaistnienia zmiany

  • Wskazanie daty zaprzestania działalności w przypadku przekształcenia w spółkę

  • Aktualizacja kodów PKD, adresu, nazwy firmy

  • Informacja o zawieszeniu działalności (jeśli dotyczy)

Wniosek można złożyć elektronicznie przez stronę CEIDG lub w dowolnym urzędzie gminy.

Krajowy Rejestr Sądowy (KRS)

W przypadku spółek obowiązki obejmują:

  • Złożenie wniosku o wpis zmiany danych w ciągu tygodnia od zdarzenia

  • Złożenie aktualnej listy wspólników (w przypadku sp. z o.o.)

  • Dołączenie dokumentów stanowiących podstawę zmiany (np. uchwały, plan przekształcenia)

  • Zgłoszenie zmiany umowy spółki lub statutu

Opłata sądowa za wpis zmiany wynosi 350 zł, a za zarejestrowanie nowego podmiotu – 600 zł.

Centralny Rejestr Beneficjentów Rzeczywistych (CRBR)

Restrukturyzacja często prowadzi do zmiany struktury właścicielskiej, co wymaga:

  • Zgłoszenia zmiany beneficjenta rzeczywistego w ciągu tygodnia od zmiany

  • Wskazania danych identyfikacyjnych nowych beneficjentów

  • Określenia charakteru stosunków łączących beneficjenta z podmiotem

  • Wskazania wielkości udziałów lub uprawnień beneficjenta

Zgłoszenie do CRBR jest bezpłatne i dokonywane wyłącznie elektronicznie.

Urząd Skarbowy – aktualizacja danych

Kluczowe formularze zgłoszeniowe dla organów podatkowych:

  • NIP-8 – aktualizacja danych podatnika (termin: tygodnia od zmiany)

  • VAT-R – aktualizacja zgłoszenia rejestracyjnego VAT (termin: 7 dni od zmiany)

  • ZAW-NR – zawiadomienie o rachunkach bankowych związanych z działalnością (termin: 7 dni od zmiany)

  • CIT-8 – informacja o zmianie roku podatkowego (termin: 30 dni przed planowaną zmianą)

Dodatkowo, w przypadku działalności międzynarodowej:

  • VAT-EU – rejestracja/aktualizacja dla potrzeb transakcji wewnątrzwspólnotowych

  • CBC-P – powiadomienie o jednostce raportującej dla informacji o grupie podmiotów

Zakład Ubezpieczeń Społecznych (ZUS)

Restrukturyzacja wymaga również aktualizacji danych w ZUS:

  • ZUS ZFA – zmiana danych płatnika składek (termin: 7 dni od zmiany)

  • ZUS ZWUA – wyrejestrowanie z ubezpieczeń (w przypadku likwidacji podmiotu)

  • ZUS ZUA/ZZA – zgłoszenie do ubezpieczeń przez nowy podmiot

  • ZUS ZSWA – informacja o przekształceniu dotyczącym pracowników szczególnych kategorii


Wystąpienie o interpretację indywidualną przed restrukturyzacją

Interpretacja indywidualna stanowi cenne narzędzie zabezpieczenia interesów podatnika w procesie restrukturyzacji.

Korzyści z uzyskania interpretacji indywidualnej

Wystąpienie o interpretację zanim przeprowadzimy restrukturyzację pozwala na:

  • Potwierdzenie planowanego rozliczenia podatkowego

  • Uzyskanie ochrony prawnej przed negatywnymi skutkami zmiany interpretacji przepisów

  • Minimalizację ryzyka sporów z organami podatkowymi

  • Możliwość skorygowania planowanej struktury transakcji

  • Zabezpieczenie przed sankcjami podatkowymi

Jak przygotować skuteczny wniosek o interpretację?

Aby zwiększyć szanse na uzyskanie korzystnej interpretacji, warto:

Szczegółowo opisać planowaną restrukturyzację:

  • Przedstawić strukturę przed i po reorganizacji

  • Wskazać precyzyjnie etapy procesu

  • Opisać stan prawny i faktyczny

  • Wyjaśnić uzasadnienie biznesowe transakcji

Jednoznacznie sformułować pytania:

  • Zadawać pytania zamknięte (tak/nie)

  • Odnosić się do konkretnych przepisów

  • Formułować pytania alternatywne

  • Ograniczyć się do kwestii podatkowych

Przedstawić własne stanowisko:

  • Uzasadnić je przepisami prawa

  • Odnieść się do orzecznictwa i doktryny

  • Wskazać korzyści i ryzyka podatkowe

  • Uzasadnić ekonomiczną racjonalność działań

Terminy i procedura uzyskania interpretacji

Proces uzyskania interpretacji indywidualnej obejmuje:

  • Złożenie wniosku (opłata 40 zł za każdy stan faktyczny/zdarzenie przyszłe)

  • Oczekiwanie na wydanie interpretacji (3 miesiące, w praktyce często 2-3 miesiące)

  • Możliwość uzupełnienia wniosku na wezwanie organu

  • Możliwość złożenia skargi do sądu administracyjnego w przypadku niekorzystnej interpretacji

Warto złożyć wniosek z odpowiednim wyprzedzeniem względem planowanej restrukturyzacji, uwzględniając czas potrzebny na jego rozpatrzenie.

Ograniczenia interpretacji indywidualnych

Należy pamiętać, że interpretacje indywidualne mają pewne ograniczenia:

  • Nie obejmują oceny czynności pod kątem klauzuli przeciwko unikaniu opodatkowania (GAAR)

  • Nie zabezpieczają w kontekście zastosowania przepisów o cenach transferowych

  • Ochrona dotyczy tylko wnioskodawcy i opisanego stanu faktycznego

  • Mogą zostać zmienione w przypadku nowelizacji przepisów

W przypadku transakcji, które mogą podlegać klauzuli GAAR, warto rozważyć wystąpienie o opinię zabezpieczającą (choć jest to procedura znacznie droższa i dłuższa).


Sankcje za brak zgłoszenia lub nierzetelne informacje

Niedopełnienie obowiązków informacyjnych związanych z restrukturyzacją może skutkować poważnymi konsekwencjami.

Odpowiedzialność w zakresie CIT i PIT

Niezgłoszenie lub nieprawidłowe zgłoszenie restrukturyzacji może prowadzić do:

  • Określenia zobowiązania podatkowego w drodze decyzji (wraz z odsetkami)

  • Zastosowania 40% sankcyjnej stawki podatku w przypadku doszacowania dochodu

  • Przedłużenia terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego

  • Niemożności skorzystania z preferencji podatkowych

Szczególnie dotkliwe sankcje dotyczą niezgłoszenia połączenia lub podziału spółek, co może skutkować zakwestionowaniem neutralności podatkowej całej operacji.

 

Sankcje w zakresie VAT

 

W obszarze podatku VAT konsekwencje mogą obejmować:

  • Odmowę prawa do odliczenia podatku naliczonego

  • Zakwestionowanie neutralności VAT transakcji dotyczących przedsiębiorstwa

  • Nałożenie dodatkowego zobowiązania podatkowego (30% kwoty zaniżenia)

  • Odpowiedzialność solidarną za zaległości podatkowe poprzednika oraz przejęte wierzytelności

  • Brak aktualizacji zgłoszenia rejestracyjnego VAT może również skutkować wykreśleniem z rejestru podatników VAT czynnych.

Odpowiedzialność karno-skarbowa

Najpoważniejsze sankcje mają charakter karno-skarbowy i mogą dotyczyć:

  • Niezłożenia deklaracji podatkowej (kara grzywny do 720 stawek dziennych)

  • Podania nieprawdy w deklaracji (kara grzywny do 720 stawek dziennych)

  • Nieujawnienia przedmiotu lub podstawy opodatkowania (kara grzywny do 720 stawek dziennych)

  • Niezgłoszenia schematu podatkowego (kara grzywny do 720 stawek dziennych)

Odpowiedzialność karna i finansowa dotyczy przede wszystkim osób odpowiedzialnych za wypełnianie obowiązków podatkowych (członków zarządu, dyrektorów finansowych).

Odpowiedzialność członków zarządu

Członkowie zarządu spółki kapitałowej mogą ponosić osobistą odpowiedzialność za:

  • Zaległości podatkowe spółki (art. 116 Ordynacji podatkowej)

  • Niedopełnienie obowiązków rejestracyjnych i informacyjnych, w tym związanych z wierzytelnościami spółki.

  • Niezgłoszenie upadłości w przypadku niewypłacalności spółki

  • Nieprawidłowości w dokumentacji podatkowej

Aby uniknąć tej odpowiedzialności, członek zarządu musi wykazać, że:

  • We właściwym czasie zgłoszono wniosek o ogłoszenie upadłości lub

  • Niezgłoszenie upadłości nastąpiło bez jego winy, lub

  • Mimo niezgłoszenia upadłości wierzyciel nie poniósł szkody

Praktyczne wskazówki minimalizacji ryzyka

Aby zminimalizować ryzyko sankcji, warto:

  • Wyznaczyć osobę odpowiedzialną za koordynację zgłoszeń i aktualizacji

  • Stworzyć listę kontrolną obowiązków informacyjnych

  • Prowadzić rejestr terminów na dokonanie zgłoszeń

  • Zachować dokumentację potwierdzającą dokonanie zgłoszeń

  • Rozważyć wsparcie profesjonalnego doradcy podatkowego

  • Ubezpieczyć odpowiedzialność członków zarządu


Podsumowanie: Profesjonalne wsparcie w procesie zgłaszania restrukturyzacji

Prawidłowe zgłoszenie restrukturyzacji do organów podatkowych i innych instytucji publicznych stanowi kluczowy element procesu reorganizacji przedsiębiorstwa. Mnogość obowiązków informacyjnych, rygorystyczne terminy oraz surowe sankcje za ich niedopełnienie sprawiają, że profesjonalne wsparcie w tym zakresie staje się niezbędne.

Kancelaria TKW Tkaczyk Kopeć Wrembel z siedzibami w Gdyni i Gdańsku specjalizuje się w kompleksowym doradztwie prawno-podatkowym w zakresie restrukturyzacji przedsiębiorstw. Nasz zespół doświadczonych radców prawnych i doradców podatkowych oferuje:

  • Przygotowanie harmonogramu zgłoszeń i aktualizacji związanych z restrukturyzacją

  • Kompleksową obsługę procesu aktualizacji danych w CEIDG, KRS, CRBR i innych rejestrach

  • Przygotowanie i złożenie zgłoszeń rejestracyjnych i aktualizacyjnych w urzędach skarbowych

  • Analizę obowiązków w zakresie raportowania schematów podatkowych (MDR)

  • Przygotowanie wniosków o interpretacje indywidualne zabezpieczające interesy podatnika

  • Reprezentację przed organami podatkowymi w przypadku kontroli lub sporu

Dzięki naszemu wsparciu proces restrukturyzacji zostanie przeprowadzony w sposób bezpieczny i zgodny z obowiązującymi przepisami, a wszystkie obowiązki informacyjne zostaną dopełnione w terminie. Zapraszamy do kontaktu przedsiębiorców planujących reorganizację działalności oraz doradców wspierających procesy restrukturyzacyjne. Profesjonalne doradztwo w zakresie zgłoszeń restrukturyzacji to inwestycja, która zwraca się w postaci unikniętych sankcji i bezpieczeństwa prawnego.