CIT, PIT i VAT po restrukturyzacji

CIT, PIT i VAT po restrukturyzacji

autor: TKW Kancelaria 

data publikacji: 05.05.2025 r.  

CIT, PIT i VAT po restrukturyzacji – co warto wiedzieć?

Restrukturyzacja przedsiębiorstwa to złożony proces, który obok zmian organizacyjnych i właścicielskich pociąga za sobą istotne konsekwencje podatkowe. Nieodpowiednie zaplanowanie aspektów podatkowych może prowadzić do poważnych komplikacji, dodatkowych kosztów, a nawet ryzyka sporów z organami podatkowymi. W niniejszym artykule omawiamy kluczowe aspekty dotyczące podatków dochodowych i VAT, które wymagają szczególnej uwagi po przeprowadzeniu procesów restrukturyzacyjnych.

Zmiana podmiotu a kontynuacja rozliczeń CIT/PIT

Jednym z podstawowych zagadnień podatkowych w procesie restrukturyzacji jest kwestia kontynuacji rozliczeń podatkowych. To, czy nowy podmiot może kontynuować obowiązki podatkowe poprzednika, zależy od formy przeprowadzonej reorganizacji.

Przekształcenie a sukcesja podatkowa

Przy przekształceniu formy prawnej przedsiębiorstwa (np. spółki jawnej w spółkę z o.o. czy jednoosobowej działalności gospodarczej w spółkę kapitałową):

  • Podmiot przekształcony wstępuje we wszystkie obowiązki podatkowe podmiotu przekształcanego (sukcesja uniwersalna)
  • Nie ma konieczności zamykania ksiąg rachunkowych i sporządzania sprawozdania finansowego na dzień przekształcenia (chyba że zmienia się rok podatkowy)
  • Podmiot przekształcony kontynuuje amortyzację środków trwałych rozpoczętą przez podmiot przekształcany
  • Zachowana zostaje ciągłość w zakresie rozliczania strat podatkowych

Przekształcenie jest zatem najbardziej „przyjazną” podatkowo formą restrukturyzacji z perspektywy kontynuacji rozliczeń.

Łączenie i podział spółek

Przy łączeniu spółek (przez przejęcie lub zawiązanie nowej spółki):

  • Spółka przejmująca lub nowo zawiązana wstępuje we wszystkie obowiązki łączonych spółek
  • Spółka przejmująca kontynuuje amortyzację środków trwałych rozpoczętą przez spółkę przejmowaną
  • Spółka przejmująca nie może jednak rozliczać strat podatkowych spółki przejmowanej

Przy podziale spółek:

  • Spółki przejmujące wstępują w obowiązki podatkowe spółki dzielonej w części określonej w planie podziału
  • Spółki przejmujące nie mogą rozliczać strat podatkowych spółki dzielonej
  • Konieczne jest zamknięcie ksiąg rachunkowych spółki dzielonej na dzień poprzedzający podział

Zmiana roku podatkowego a obowiązki sprawozdawcze

Restrukturyzacja może wiązać się ze zmianą roku podatkowego, co pociąga za sobą określone konsekwencje:

  • Konieczność zamknięcia ksiąg rachunkowych i sporządzenia sprawozdania finansowego
  • Złożenie zeznania podatkowego za okres od początku roku do dnia kończącego dotychczasowy rok podatkowy (w terminie 3 miesięcy)
  • Zawiadomienie naczelnika urzędu skarbowego o zmianie roku podatkowego (w terminie 30 dni)

Zmiana roku podatkowego może być strategicznym elementem planowania podatkowego, pozwalającym na optymalizację momentu rozpoznania przychodów i kosztów.

Przekształcenie jednoosobowej działalności gospodarczej

Specyficzne zasady dotyczą przekształcenia jednoosobowej działalności gospodarczej w spółkę kapitałową:

  • Konieczność zamknięcia ksiąg podatkowych prowadzonych dla celów PIT
  • Ustalenie dochodu na dzień przekształcenia i złożenie zeznania rocznego PIT-36/PIT-36L w standardowym terminie
  • Rozpoczęcie prowadzenia ksiąg dla celów CIT od dnia przekształcenia
  • Brak możliwości przejęcia strat podatkowych z jednoosobowej działalności

Obowiązki w zakresie VAT – rejestracja, rozliczenia, korekty

Restrukturyzacja przedsiębiorstwa może istotnie wpłynąć na obowiązki w zakresie podatku VAT, wymagając aktualizacji danych, a w niektórych sytuacjach nawet ponownej rejestracji.

Rejestracja i aktualizacja danych VAT

W zależności od formy restrukturyzacji, obowiązki rejestracyjne mogą się różnić:

Przekształcenie:

  • Brak konieczności wyrejestrowania i ponownej rejestracji jako podatnik VAT
  • Obowiązek aktualizacji danych poprzez złożenie zgłoszenia VAT-R w terminie 7 dni od dnia przekształcenia
  • Zachowanie dotychczasowego numeru NIP (co znacząco upraszcza procedury)

Połączenie i podział:

  • Przy połączeniu przez przejęcie – spółka przejmująca aktualizuje dane poprzez zgłoszenie VAT-R
  • Przy połączeniu przez zawiązanie nowej spółki – konieczna jest rejestracja nowego podmiotu jako podatnika VAT
  • Przy podziale – spółki przejmujące lub nowo zawiązane muszą dokonać rejestracji VAT

Nabycie przedsiębiorstwa lub ZCP:

  • Nabywca musi dokonać aktualizacji danych lub nowej rejestracji (jeśli wcześniej nie był podatnikiem VAT)
  • Zbywca pozostaje zarejestrowanym podatnikiem VAT (chyba że dochodzi do pełnej likwidacji)

Korekty faktur i JPK po reorganizacji

Po restrukturyzacji może zachodzić konieczność korygowania wystawionych wcześniej faktur:

  • Przy przekształceniu – zasadniczo nie ma konieczności korygowania faktur (zachowany jest ten sam NIP)
  • Przy połączeniu lub podziale – faktury wystawione przez spółki, które przestały istnieć, mogą wymagać korekt formalnych
  • W sytuacji zmiany formy rozliczeń VAT (np. z miesięcznej na kwartalną) – konieczna jest korekta JPK_VAT

Szczególnej uwagi wymaga kwestia faktur wystawianych po dniu restrukturyzacji, ale dotyczących zdarzeń gospodarczych sprzed tego dnia – zasady ich wystawiania zależą od formy przeprowadzonej reorganizacji i zakresu sukcesji.

Sukcesja w zakresie VAT od WNT i importu usług

W sytuacji wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów (WNT) oraz importu usług restrukturyzacja może wpływać na moment i sposób rozpoznania obowiązku podatkowego:

  • Podmiot będący sukcesorem przejmuje obowiązki w zakresie nierozliczonych transakcji
  • W sytuacji zmiany identyfikatorów VAT-UE może zachodzić konieczność skorygowania dokumentów
  • Należy zweryfikować wpływ zmian na rozliczenia w systemie VIES

Korekta wieloletnia VAT dla nieruchomości

Szczególnej uwagi wymaga kwestia wieloletnich korekt VAT dla nieruchomości:

  • 10-letni okres korekty dla nieruchomości podlega kontynuacji przez następcę prawnego
  • Przy przekształceniu – podmiot przekształcony kontynuuje korekty rozpoczęte przez podmiot przekształcany
  • Przy połączeniu – spółka przejmująca kontynuuje korekty spółki przejmowanej
  • Przy podziale – spółki przejmujące kontynuują korekty w zakresie przejętych nieruchomości

Rozliczenie przychodów i kosztów po przekształceniu

Prawidłowe rozliczenie przychodów i kosztów po restrukturyzacji jest kluczowe dla uniknięcia ryzyka podatkowego i zapewnienia ciągłości rozliczeń.

Kontynuacja wartości podatkowych aktywów

W większości form restrukturyzacji zachowana jest ciągłość wartości podatkowych aktywów:

  • Podmiot przekształcony, przejmujący lub nowo zawiązany kontynuuje wartości początkowe środków trwałych
  • Wartości niematerialne i prawne zachowują swoją dotychczasową wartość podatkową
  • Zapasy i inne składniki majątku obrotowego przejmowane są według wartości wynikających z ksiąg podmiotu restrukturyzowanego

Wyjątkiem jest nabycie przedsiębiorstwa lub jego zorganizowanej części za środki pieniężne, gdzie konieczne jest ustalenie nowych wartości początkowych na podstawie ceny nabycia.

Amortyzacja po restrukturyzacji

Zasady kontynuacji amortyzacji zależą od formy przeprowadzonej reorganizacji:

Przekształcenie:

  • Pełna kontynuacja amortyzacji (metoda, stawki, wartość początkowa)
  • Brak możliwości zmiany metody amortyzacji wyłącznie z powodu przekształcenia
  • Zachowanie możliwości kontynuacji amortyzacji przy przyspieszonej metodzie

Połączenie i podział:

  • Spółka przejmująca kontynuuje amortyzację spółki przejmowanej według dotychczasowych zasad
  • W sytuacji neutralnego podatkowo połączenia/podziału – zakaz zmiany metody amortyzacji
  • Przy połączeniu/podziale niespełniającym warunków neutralności – możliwość ustalenia nowych wartości początkowych i zasad amortyzacji

Nabycie przedsiębiorstwa:

  • Nabywca ustala nowe wartości początkowe według ceny nabycia
  • Możliwość wyboru metody amortyzacji niezależnie od stosowanej przez zbywcę
  • Konieczność wyodrębnienia i amortyzacji wartości firmy (jeśli powstała)

Rozliczenie umów leasingowych

Szczególnej uwagi wymaga kwestia kontynuacji umów leasingowych:

  • Przy przekształceniu – pełna kontynuacja rozliczeń podatkowych leasingu
  • Przy połączeniu – spółka przejmująca kontynuuje rozliczenia leasingowe spółki przejmowanej
  • Przy zmianie formy opodatkowania (np. z PIT na CIT) – konieczność analizy wpływu zmiany na klasyfikację leasingu
  • W sytuacji nabycia przedsiębiorstwa – konieczność analizy wpływu przejęcia umów leasingowych na ich klasyfikację podatkową

Należności i zobowiązania po restrukturyzacji

Rozliczenie należności i zobowiązań po restrukturyzacji zależy od formy przeprowadzonej reorganizacji:

  • W sytuacji sukcesji uniwersalnej – pełne przejęcie obowiązków związanych z należnościami i zobowiązaniami
  • Przy przekształceniu/połączeniu – kontynuacja rozliczeń bez konieczności wystawiania nowych dokumentów
  • W sytuacji nabycia przedsiębiorstwa – konieczność formalnego przejęcia należności i zobowiązań (cesja, przejęcie długu)

Szczególnej uwagi wymaga kwestia utworzonych wcześniej odpisów aktualizujących oraz rezerw.

Zmiany w zobowiązaniach wobec ZUS i urzędów skarbowych

Restrukturyzacja przedsiębiorstwa wymaga także odpowiedniego zaktualizowania danych i dostosowania rozliczeń z instytucjami publicznymi.

Aktualizacja danych w ZUS

W zależności od formy restrukturyzacji, obowiązki wobec ZUS mogą się różnić:

Przekształcenie:

  • Konieczność złożenia formularza ZUS ZFA (zmiana danych płatnika)
  • Brak konieczności wyrejestrowania pracowników i ponownego ich zgłaszania
  • Zachowanie ciągłości w zakresie obowiązków ubezpieczeniowych

Połączenie i podział:

  • Przy połączeniu – spółka przejmująca aktualizuje dane poprzez formularz ZUS ZFA
  • Przy podziale – spółki przejmujące muszą dokonać zgłoszenia jako płatnicy składek
  • Konieczność aktualizacji danych dotyczących pracowników

Nabycie przedsiębiorstwa:

  • Nabywca musi zgłosić przejętych pracowników jako nowy płatnik
  • Zbywca wyrejestrowuje przekazanych pracowników

Aktualizacja danych w urzędzie skarbowym

Obowiązki informacyjne wobec organów podatkowych obejmują:

  • Złożenie aktualizacji zgłoszenia identyfikacyjnego NIP-8 (w terminie 7 dni od zmiany)
  • Zawiadomienie o zmianie adresu siedziby lub zarządu (w terminie 30 dni)
  • Informacja o rachunkach bankowych wykorzystywanych w działalności gospodarczej
  • Zawiadomienie o zmianie roku podatkowego (jeśli dotyczy)

Przejęcie zobowiązań publicznoprawnych

Zakres odpowiedzialności za zobowiązania publicznoprawne zależy od formy restrukturyzacji:

Przekształcenie:

  • Pełna odpowiedzialność podmiotu przekształconego za zobowiązania podmiotu przekształcanego
  • Brak możliwości ograniczenia odpowiedzialności w drodze umowy

Połączenie i podział:

  • Przy połączeniu – spółka przejmująca odpowiada za wszystkie zobowiązania spółki przejmowanej
  • W sytuacji podziału – spółki przejmujące odpowiadają solidarnie za zobowiązania spółki dzielonej (z możliwością umownego ograniczenia)

Nabycie przedsiębiorstwa:

  • Nabywca odpowiada solidarnie ze zbywcą za zobowiązania związane z prowadzeniem przedsiębiorstwa (do wartości nabytych składników)
  • Odpowiedzialność dotyczy zobowiązań, które były wymagalne przed nabyciem
  • Możliwość ograniczenia odpowiedzialności poprzez uzyskanie zaświadczeń o niezaleganiu z zobowiązaniami publicznoprawnymi

Zmiana rachunków bankowych a rozliczenia z fiskusem

Restrukturyzacja często wiąże się ze zmianą rachunków bankowych, co wymaga:

  • Aktualizacji informacji o rachunkach w CEIDG lub KRS
  • Zgłoszenia rachunku do urzędu skarbowego jako rachunku związanego z prowadzeniem gospodarczym
  • Aktualizacji rachunku do zwrotów VAT
  • Uwzględnienia nowych wymogów dotyczących mechanizmu podzielonej płatności (split payment)

Czy koszty restrukturyzacji są odliczalne od podatku?

Koszty związane z procesem restrukturyzacji przedsiębiorstwa mogą stanowić koszty uzyskania przychodów, jednak ich kwalifikacja podatkowa zależy od szeregu czynników. Zgodnie z przepisami ustawy o podatku dochodowym, aby wydatek mógł zostać uznany za koszt podatkowy, musi być poniesiony w celu osiągnięcia przychodów, zachowania lub zabezpieczenia źródła przychodów.

Koszty doradztwa i obsługi prawnej

Wydatki na usługi doradcze, prawne i finansowe związane z przeprowadzeniem postępowania restrukturyzacyjnego najczęściej mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów, jeżeli:

  • Mają bezpośredni związek z prowadzoną działalnością gospodarczą
  • Są odpowiednio udokumentowane (faktury, umowy)
  • Ich poniesienie ma racjonalne uzasadnienie gospodarcze

Koszty reorganizacji struktury zatrudnienia

Wydatki związane z restrukturyzacją zatrudnienia, takie jak:

  • Odprawy dla zwalnianych pracowników
  • Koszty przekwalifikowania pracowników
  • Odszkodowania z tytułu zakazu konkurencji

mogą stanowić koszty uzyskania przychodów, jeżeli są ponoszone w związku z racjonalizacją działalności i mają na celu poprawę efektywności ekonomicznej przedsiębiorstwa.

Koszty zbycia lub likwidacji majątku

W trakcie postępowania restrukturyzacyjnego często dochodzi do zbycia lub likwidacji części majątku. W takim przypadku:

  • Niezamortyzowana wartość likwidowanych środków trwałych może zostać zaliczona do kosztów podatkowych
  • Koszty związane z likwidacją (np. demontaż, utylizacja) zwiększają koszty uzyskania przychodów
  • W przypadku sprzedaży majątku – kosztem jest wartość początkowa pomniejszona o dokonane odpisy amortyzacyjne

Moment rozpoznania kosztów restrukturyzacji

Zgodnie z przepisami ustawy, koszty restrukturyzacji rozpoznaje się co do zasady w dacie ich poniesienia, jednak:

  • Koszty bezpośrednio związane z przychodami rozpoznaje się w roku podatkowym, w którym osiągnięto odpowiadające im przychody
  • Koszty pośrednie rozpoznaje się w dacie ich poniesienia, nie później niż w roku podatkowym, którego dotyczą
  • W przypadku wydatków rozłożonych w czasie (np. odprawy płatne w ratach) – koszty rozpoznaje się zgodnie z zasadą memoriałową

Ograniczenia w odliczaniu kosztów restrukturyzacji

Należy pamiętać, że nie wszystkie wydatki związane z restrukturyzacją mogą być kwalifikowane jako koszty podatkowe. Przepisy ustawy wyłączają możliwość zaliczenia do kosztów m.in.:

  • Kar umownych i odszkodowań z tytułu wad dostarczonych towarów, wykonanych robót i usług
  • Odsetek za zwłokę w zapłacie zobowiązań, w tym podatkowych
  • Grzywien i kar pieniężnych orzeczonych w postępowaniu karnym, karnym skarbowym lub administracyjnym
  • Wydatków na nabycie lub objęcie udziałów (akcji) albo wkładów w spółdzielni

W każdym przypadku konieczna jest indywidualna analiza możliwości zaliczenia danego wydatku do kosztów podatkowych w kontekście konkretnego postępowania restrukturyzacyjnego i przepisów ustawy podatkowej.

Możliwość kontynuacji ulg i zwolnień podatkowych

Zachowanie możliwości korzystania z ulg i zwolnień podatkowych po restrukturyzacji jest istotnym elementem planowania podatkowego.

Ulga badawczo-rozwojowa (B+R)

W kontekście ulgi B+R kluczowe znaczenie ma forma przeprowadzonej restrukturyzacji:

Przekształcenie:

  • Pełna kontynuacja możliwości korzystania z ulgi B+R
  • Możliwość odliczenia kosztów kwalifikowanych poniesionych przez podmiot przekształcany
  • Zachowanie możliwości rozliczenia niewykorzystanej ulgi w kolejnych latach

Połączenie i podział:

  • Spółka przejmująca może kontynuować odliczenia z tytułu ulgi B+R spółki przejmowanej (w sytuacji połączenia)
  • W sytuacji podziału – możliwość ulgi przechodzi na spółki przejmujące w zakresie przejętej działalności B+R
  • Konieczna jest kontynuacja projektów B+R w niezmienionym zakresie

Nabycie przedsiębiorstwa:

  • Nabywca nie przejmuje automatycznie możliwości ulgi B+R zbywcy
  • Możliwe jest jednak nabycie wyników prac B+R i kontynuowanie działalności badawczo-rozwojowej

Preferencyjne opodatkowanie dochodów z kwalifikowanych praw IP (IP Box)

Restrukturyzacja może wpływać na możliwość korzystania z preferencyjnej 5% stawki podatkowej dla dochodów z kwalifikowanych praw własności intelektualnej:

Przekształcenie:

  • Podmiot przekształcony kontynuuje IP Box
  • Zachowanie ciągłości w zakresie spełniania warunków zastosowania preferencji
  • Konieczność prowadzenia ewidencji w sposób umożliwiający identyfikację każdego kwalifikowanego prawa IP

Połączenie i podział:

  • W sytuacji połączenia – spółka przejmująca może kontynuować stosowanie IP Box dla przejętych praw IP
  • Przy podziale – możliwość preferencji przechodzi na spółki przejmujące w zakresie przejętych kwalifikowanych praw IP
  • Konieczne jest spełnienie warunku poniesienia kosztów na rozwój tych praw (warunek nexus)

Nabycie praw IP:

  • Nabywca może stosować preferencyjną stawkę do nabytych praw IP, jeśli sam prowadził działalność rozwojową
  • Istotne jest zachowanie wymogów dokumentacyjnych i spełnienie warunku nexus

Zwolnienia podatkowe dla działalności w specjalnych strefach ekonomicznych (SSE) i Polskiej Strefie Inwestycji (PSI)

Zmiana struktury przedsiębiorstwa może istotnie wpłynąć na możliwość zwolnień strefowych:

Przekształcenie:

  • Podmiot przekształcony zachowuje możliwość zwolnienia wynikającego z zezwolenia/decyzji o wsparciu
  • Konieczna może być zmiana zezwolenia w zakresie danych identyfikacyjnych
  • Obowiązek kontynuacji inwestycji zgodnie z warunkami zezwolenia/decyzji

Połączenie i podział:

  • W sytuacji połączenia – spółka przejmująca może przejąć możliwości wynikające z zezwolenia/decyzji o wsparciu
  • Przy podziale – możliwość zwolnienia może przejść na spółkę przejmującą działalność strefową
  • Wymagana jest zazwyczaj zgoda organu wydającego zezwolenie/decyzję

Nabycie przedsiębiorstwa:

  • Możliwości wynikające z zezwolenia/decyzji o wsparciu nie przechodzą automatycznie na nabywcę
  • Możliwe jest wystąpienie o zmianę lub nowe zezwolenie/decyzję

Zabezpieczenie możliwości ulg i zwolnień

Aby zminimalizować ryzyko utraty możliwości ulg i zwolnień podatkowych po restrukturyzacji, warto:

  • Uzyskać interpretację indywidualną przed przeprowadzeniem restrukturyzacji
  • Dokładnie udokumentować przejęcie działalności objętej ulgami lub zwolnieniami
  • Zapewnić faktyczną kontynuację działalności w niezmienionym zakresie
  • Utrzymać wymagane wskaźniki ekonomiczne (np. zatrudnienie, wartość inwestycji)
  • Prowadzić oddzielną ewidencję dla działalności objętej preferencjami podatkowymi

Podsumowanie: Profesjonalne doradztwo podatkowe po restrukturyzacji

Restrukturyzacja przedsiębiorstwa pociąga za sobą liczne konsekwencje podatkowe, które wymagają starannego zaplanowania i kompleksowego podejścia. Prawidłowe rozliczenie podatków dochodowych i VAT po reorganizacji jest kluczowe dla uniknięcia ryzyk podatkowych i potencjalnych sporów z organami skarbowymi.

Kancelaria TKW Tkaczyk Kopeć Wrembel z siedzibami w Gdyni i Gdańsku specjalizuje się w kompleksowym doradztwie podatkowym związanym z procesami restrukturyzacyjnymi. Nasz zespół doświadczonych radców prawnych i doradców podatkowych oferuje:

  • Planowanie podatkowe procesów restrukturyzacyjnych uwzględniające specyfikę CIT, PIT i VAT
  • Wsparcie w przeprowadzeniu due diligence podatkowego przed reorganizacją
  • Przygotowanie dokumentacji podatkowej związanej z restrukturyzacją
  • Doradztwo w zakresie zachowania możliwości ulg i zwolnień podatkowych
  • Reprezentację przed organami podatkowymi w sprawach związanych z restrukturyzacją
  • Wsparcie w uzyskaniu interpretacji indywidualnych zabezpieczających interesy podatkowe

Dzięki naszemu wsparciu proces restrukturyzacji zostanie przeprowadzony w sposób bezpieczny podatkowo, z zachowaniem ciągłości rozliczeń i możliwości korzystania z preferencji podatkowych. Zapraszamy do kontaktu przedsiębiorców planujących procesy restrukturyzacyjne lub potrzebujących wsparcia w uporządkowaniu kwestii podatkowych po przeprowadzonej reorganizacji. Profesjonalne doradztwo podatkowe to inwestycja, która zwraca się w postaci bezpieczeństwa fiskalnego i zoptymalizowanych obciążeń podatkowych.